GMP、SSOP、HACCP共同的目的都是使企業具有完善、可靠的食品安全衛生質量保證體系，確保生產出安全的食品，保障消費者的安全和健康。GMP、SSOP控制的是一般的食品衛生方面的危害。GMP、SSOP是制定和實施HACCP計劃的基礎和前提。SSOP計劃中的某些內容可以列入HACCP計劃內。僅僅實施GMP和SSOP，企業要靠事后檢驗解決一般的食品衛生問題。如果企業在滿足GMP和SSOP基礎上實施HACCP計劃，則可以將食品安全的顯著危害預防、控制和消滅在事前。

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